（一）投资种类
在吉注册公司分为外国公司在当地设分公司或办事处和私人注册公司两种情况，私人注册只需提供个人合法身份证明并在当地银行开有账户即可通过公证人，到吉布提政府制定的律师事务所办理。重大投资（1亿吉郎以上）可以通过吉布提国家投资促进局（Agence Nationale pour la Promotion des Investissements，ANPI）办理。该机构为官方投资促进服务机构，可以为外国投资者提供企业注册、许可证、移民办公室、签证、驾照、短期居留证、工作证等一站式服务。投资方式比较灵活，没有限制。可以自己创建全资外资公司，也可以对现有吉布提企业进行购买或参股。在吉布提保税区内设立企业，可享受保税区提供的一站式服务，48小时内完成各种繁杂的手续。
（二）私人公司注册程序
1、 公证人（Notaire）：首先向公证人说明开办公司的性质，内容，经营什么，注册资本以及合伙人（即股东），股东所占的股份比。其次向公证人洽谈公证人酬金，酬金谈妥后，公证人会告诉注册费用，包括印花税。这部分费用基本上是固定的，是向国家缴纳。
2、 向公证人支付了公证费用和酬金，并提供股东有效证件（身份证、护照等），公证人根据要求，起草公司章程。
3、 公证人起草好公司章程，交给所有股东过目，如果没有疑义，就在公司章程上签字。如果股东不能出席，则要有股东本人的授权书。同时要求公证人出具到银行开立帐户的函。函中有注册资本。
4、 注册公司的人拿着所有股东签过字的公司章程及包括公司股东的证件（如身份证、护照等有效证件）复印件及公证人出具开立银行帐户的函，到银行去开立银行临时帐户。向银行提供上述文件外和全额注册资本，还要询问银行是否需要补充材料，如果需要，要将补充材料交齐。然后，银行进行审核，如果银行觉得还需要补充材料，要向银行提供补充材料。银行审核后，同意开立银行帐户，同时将出具一份注册资本到位的函。
5、 将银行出具的注册资本函，交给公证人，公证人将公司章程报送到税务局（H?tel des Imp?ts）审批，大约一周时间。
6、 公证人将税务局审批的公司章程从税务局取回，再报送到商业法院，进行商务登记注册。时间约一周到两周。公证人会打电话告知。
7、 拿到有公证人签字的登记注册后的公司章程及商业法院的回执复印件，公司原件留存在公证人那里存放，如果需要，公证人会随时提供复印件并进行公证签字。再到银行要求开立正式帐户，银行各部门开始正式审核公司所提供的文件，经过审核后，各部门签字，才正式通知在银行开立帐户的帐户名及帐号（外汇和当地货币帐号）
8、 拿到有公证人签字的登记注册后的公司章程及商业法院的回执复印件，到税务局秘书处办理营业执照，领取公司营业执照登记表，进行填写并贴上500吉朗的印花税。将公证人签字后的公司章程和登记注册回执复印件及营业执照登记表一并交给税务局秘书处，秘书处给一个文件查询号码，并告知到警察局局长秘书处查询。
9、 拿到文件查询号码后，就要到警察局秘书处查询，跟踪文件。警察局秘书处会给另一个查询号码，告知到警察分局。
10、到警察分局，查询文件，警察分局收到文件后，开始对公司注册人进行调查询问，公司地址、电话，籍贯等等，调查完后，文件会返回到警察局秘书处。
11、再到警察局秘书处，索要文件查询号码，到财政部秘书处查询。财政部秘书处经过审核后，将文件返回到税务局秘书处。同时会给一文件查询号码。拿着这个号码到税务局秘书处。
12、到税务局秘书处查到文件后，就到企业科办理相关手续，缴纳营业执照税。营业执照税是根据不同的行业划分的，如商业、加工、建筑等营业执照税是不一样的。企业科开营业执照税单，拿着税单，在一楼交税。税缴完后，拿着缴税单收据，到企业科，企业科再打印纳税证明和营业执照行业证。纳税证明一般三天内可以取到。取到营业执照行业证和纳税证明，才算公司正式成立，可以营运。
13、注册公司还必须到社会保障局（Organisation de Protection Sociale）备案，获得雇主注册号，并按时为职工缴纳社会福利税，由家庭补助、工伤医疗、养老金三部分组成，由雇主负担的部分为工资的15.7%，职工个人负担4%。另外还需到就业部下属的劳动监察处（Inspection du Travail）和就业处（Service National de l'Emploi）申报。
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